Xcos refactoring: move link classes

There is only one class per kind of link ; moving them all to the same
package helps browsing the source code.

Change-Id: Ic677aac0f0160dfccd1d04efd192d35af4a09e3b

Xcos GUI: fix create a link from another link

The `linkKlass.newInstance()` method is not visible anymore on Xcos 6. We
have to create an MVC ID and then pass it to the constructor.

Change-Id: I1a0b07e63bb2cea4d2238a408cb346ed8742763d

Xcos decoding: manage mixed xcos files

Some Xcos / Zcos files store partially decoded sub-diagrams. This commit
manage such sub-diagrams contained into such a sub-diagrams.

After this conversion, the saved xcos / zcos files will contain
a complete XML representation.

Change-Id: Ia7dc4168405c8716c73c52461272b02c3117589d

Xcos vec2var: fix String and TList / MList

 * String encoding was invalid, the offsets were wrongly encoded
 * TList / MList had wrong size (header should be included)

Change-Id: I748949848302e2f34c8c91d0c88a886a236d0626

Xcos writer: fix an issue on List decoding

Change-Id: I094b0b836534aae380df58650fd4c0ffbae76936

Xcos I/O: decode more properties and store them

 * manage SuperBlock with an rpar MList (mixed schema)
 * add some properties
 * use the same ordering properties between handlers and writers
 * write the version comment at the beginning

Change-Id: I0ce3415039bb6331884fc9f3fdb2136ac51802d4

Xcos writers: fix ScilabString encoding

Change-Id: I1509fe9f9e3319a008f5adbe5e527e400b9412a5

Xcos writers: sort the children

Sort the children preserving their relative order to preserve the order of
the scs_m accross multiple load and save operations.

Change-Id: I33b209718c8ad90fb69f9cecdc6ecb7a649e22b3

Xcos writers: indent ".xcos" files

Change-Id: Ife0a0230dc7bb28fd2bd339fdb7155a9429b16b3

Xcos writers: add the "defaultParent" to the XML

Change-Id: Ib0ba685e20918ffd3215fff097845f5ab9e01672

Xcos decode: load list on xcos files

Change-Id: I420c5d0a9e20fc88402dec3693bd38d96c62e1e0

Xcos import: returns errors on error

Change-Id: I38203f8c330de6b77abca61fcb7aaad5aac8348e

Xcos: save and load the DEBUG_LEVEL

This property is now part of a diagram thus it should be saved as any other
property.

Change-Id: I88f830c3cc021526e0b67933a974061acb05c464

Xcos: launch a simulation

This commit also manage :
 * `scicos_new("0x2")` for Scilab calls from Java using a Java long
 * DEBUG_LEVEL as a model property

Change-Id: I1226b6ac0fd530304bfcca785ce5ee15f823386b

UMFPACK: fix some memory leak on normal case

Change-Id: I789b0bdeb1de9556a828b105e6ea5ac18b662fef

segfault fixed when bad SCI environment variable is setted when using call_scilab.

Change-Id: I7af8b9587f4c354a148a947245702d6715ec3f07

[bug_14253] Insertion in a struct contained in a list fixed.

Change-Id: I4ac4ceb9bafc679c82a22163bbb84c38012ce982

bug 13990: Windows installer does not ship all localization files

Change-Id: I8bb7dad8baceca96dfcecd8dc0fb7d9e40be7bcc

* Bug #14251 fixed - `spec` leaked some memory.

Change-Id: If59366cf3ed9c64782d1b87d63fb8798eb28e2cf

Xcos MVC: fix 'style' for Annotations

 * Treat Annotations like blocks so fill their 'gui' property (still nothing saved in the model though).

Change-Id: Iaa7714cc05fc3fe4dbc88c49ee030096e4b22eec

Bug 14257: Fixed English spelling in messages and in comments

Change-Id: I66f6bb2e1912fae98dbb90dcd6e4559cadd5816d

Better error message when error during doc generation

Change-Id: I03c98a27d5298d36511bf5b7752a14f7f11f0c51

Configure: reuse the same Java class to check #2

The `find -printf` is not available on Os X, this commit uses only
compatible behavior.

Change-Id: Ic410c9541f6b0714f2854c5f51f21ab9ee103e45

Configure: reuse the same Java class to check

This avoid the compilation time + execution foreach (java class * classpath
dir). It slightly improves the configure time for JAR dependencies.

On my machine, `time ./configure` returns :
 1m22.301s before
 0m29.333s after

Change-Id: I5ad28debb9d608367b9635f87ad613cded87ccdd

fix bug on s(f)grayplot after https://codereview.scilab.org/#/c/17405/

Change-Id: Ic00f0f273183599cf084dbaa6523e38caf8e08c9

Update localization

The script to dispatch the localization now handle the launchpad tarball
as an argument.

Change-Id: I2d068d160aaee42f50fd8f4ce6f89ed7aa68ca1f

FREE(str) when str is NULL crashed Scilab.
To test: Demos > Graphics > 2D and 3D plots > plot2d3

Change-Id: I31b1be349649a8df52979f77ddb66877c251424d

[bug_14225] Scilab binary return 1 when an error occured in scilab before exit. Return 0 in succesfull case.

./bin/scilab-cli -e "1+1;" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "1+1; exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch, disp(lasterror()),end" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch,disp(lasterror());exit(12), end" -quit;echo $?

test_run core bug_14225

Change-Id: I3af6be334934d42a1c0677db2a8e62e8d63d8eae

Complete overview and changelog, including in French

Change-Id: Ic531839d07654f55dfd793fda20387b09f30f114

Better names for coverage report

Change-Id: Ic6d74ef5314c559a9707d5941aded0a10b42ccd9

update changes to bug_12044

Change-Id: I14a23cb9fe8575a7e4bd9057996a4752f7cf1d6d

Xcos: save on the GUI and open block settings

Change-Id: Id3468d3d90e5d5f627e8c820bc91f3f934ed70ac

Xcos MVC: implement XCOS / ZCOS file saving

 * Add a DESCRIPTION property for blocks' value
 * Handle both binary and textual saving
 * testing is performed manually using xcosDiagramToScilab calls

Change-Id: If60686a54e87d6b127886d38592f93f9b0bd3ed3

add missing Makefile.in after https://codereview.scilab.org/#/c/17366/

Change-Id: Ia0478a9301a1b55628a8e27c587c1829f4f9738c

Adding or substracting the empty matrix now return an empty matrix

Change-Id: Ib2d41ea4fc44ea3624c849231c01f65aa49bd0c6

Configure: detect Atlas using pkg-config

Change-Id: Ibc050a69a02a902a448bd57df631398ec97728a3

* Bug #14232 fixed - Typo fixes

Change-Id: Ic7e098c3246d667ea0b0ff146fae93048bbe7dae

The initial mode value of ieee function is setted to 2.

Change-Id: Ie3c727863f7bb986e8678aaf9e729a30112c00bc

Java types: implement hashCode()

Change-Id: I3ae1c697b004331929828da231fbd6b132000730

bug_14204: fix swap of error messages in dec2base

Change-Id: Ice980d880897cb0373cf10fb927ed021b5ca052e

Scicos: getting the objs content crashed

Change-Id: I582b7d4a812cd867f5d9302644500c34af77b300

add coverage in Windows installer

Change-Id: I2ed8e398edc2079be03a5b1a782385e6d6c84c10

Do not default to static linking for libstdc++

1. dlopen-ed C++ library might not work
2. People using older libstdc++ / glibc can easily preload a backported
   version at Scilab startup
3. The compilation chain now targets an old glibc / libstdc++ (RHEL 5)

In depth, rationale :
http://www.trilithium.com/johan/2005/06/static-libstdc/

Change-Id: I22b15d791e945a04879dc6f4737310f2849e960e

remove cnes configuration files from Windows installer

Change-Id: I6eb54093933fdf0d3cb32e22509b66dab8545169

Slint: avoid crash when destination file can't be created

Change-Id: I32d12ab4332e0aee3b181fb742f56ba1b1229cc1

Cov: instrument correctly case exp

Change-Id: I4f6928e124fc14fe76bf91a620d71fa0ac21182a

SLint: remove all CNES code

Change-Id: I57a4f9869f0703424e4a7e1b1aa949182dcf8732

extract with ImplicitList fixed

test_run ast implicitlist

Change-Id: I26046e47279376bbcf572bc528cf18e8f0a9bbbb

operation 'or' fixed

test_run elementary_functions acosd
test_run elementary_functions asind

Change-Id: Ib622d321744afe4426637926e5c016eeb9bb2449

* Bug #14223 fixed - det returned an error when it is used with a singular matrix.

Change-Id: I69172b2c60bced9653955bac5d9d65206acde493

Xcos model: use vec2var encoding for EQUATIONS

Change-Id: I209dac0c8fa2aa71c3a84e599993dcdd615cf2e9

Xcos: remove std::nothrow dependency

This usage seems to break static-libstdc++ linkage for a unknown reason.
Remove them to pass the compilation chain.

Change-Id: I007ea82fab2f7b7d934bdb43390cdc0ad88e2105

fix bug after https://codereview.scilab.org/#/c/17413/

Change-Id: I48403d47e1da4a2588c60b2a9cb1fa0d18a35e67

a little speed improvement at call of C gateway

Change-Id: I8994e4c81cb82d9848eea136010533066a2b1c85

remove types_gw from Windows installer

Change-Id: Ia94244998a3261e9951352d616b87fd91a3bb592

coverage must be link staticly to scilab

Change-Id: I1db1bbf911384313b0aae4f8d2098d6375bb0f45

fix non handled exception if error occurs in scilab.start

Change-Id: Id491d15fecc4dcf65b1d679f142891e6fb8eeec5

add management of mode(7)

Change-Id: I5abfa67306e755522ed25a836cd603079ab5af03

Scicos src: vec2var now errors out on empty string/integer matrices

 * Empty string or integer matrices don't exist in Scilab, so error out when they are detected

Change-Id: Id32880df6de3e71cf436ce116884166e952c95de

Xcos MVC: Fixed objects content for compatibility between Scicos and Xcos

 * A superblock still contains children information but not the whole diargam anymore: it is regenerated on demand

 * Example to show that all model elements are cleared (here with SuperBlock):
 grep "objectCreated" tests/unit_tests/model/SuperBlock.dia.ref | wc -l
  = 83
 grep "objectDeleted" tests/unit_tests/model/SuperBlock.dia.ref | wc -l
  = 83

Change-Id: I89c82e65d05cc838b0e270b87d9ba90717ae6878

update "some" def files

Change-Id: I0856b4f36184cd60aaf5eba7e04db025235dcca9

re enable < indirection on command line under Windows

bin/scilex -nwni < file.sce &> output.log

Change-Id: Ie1aac79d7561b249e1da94746e21797a3951971c

memory leak in arrayof fixed

Change-Id: I0c5f421745ea3ef51128d1b9438dd4b28601ff65

move gateway about types from module types to core

  * fix scilab built with --wtout-gui flag

Change-Id: Iec72eeb4ebdafb0c51a801d4a7e0c0889dc29c5e

double delete of Library fixed

./bin/scilab-cli -profiling -e "loadXcosLibs" -quit &> log

test_run ast library
test_run ast library mode_nwni_profiling

Change-Id: I8e2bdafb275c65209588b515c2cc3b65b5aa703f

Add a code coverage tool

Change-Id: I1fbbef61b54db27deae6f70748ff492bdf463659

Scicos tests: fix default values and regenerate ref files

 * New property 'UID' and fix default values for 'exprs', 'odstate' & 'opar',
now that var2vec is mapped on sci_types

Change-Id: I1fa895fc06aef456a2be609873a5b37c9a28d4f5

Linux compilation fixed with --with-mpi flag

Change-Id: I8ebfd24fb9b47e7e221ed56a8581caac450d2018

* Bug #13931 fixed - handle "aarch64" processor for some Linux distribution.

Thanks to Martin Michlmayr for the patch.

Change-Id: Iae5bc7c8974be4c0c1034b47a43257a7358f355d

Xcos GUI: convert values only for scicos geometries

Change-Id: If4e8309bcffeccb58a901c8a51ec77a84a708ead

Xcos GUI: fix ZCOS reading

 * Some ZCOS files define ports twice, so only read them once.
Don't create a new object in the model but resync them.

// Positioning & sizes need to be fixed but the import passes!
--> xcos(SCI + "/modules/xcos/demos/Simple_Demo.zcos");

Change-Id: Ifc47aec6f83b72df151b79c5019f352ba5f6b900

Xcos GUI: fixed Annotations loading

// Does not pass yet but getting closer
--> importXcosDiagram(SCI + "/modules/xcos/demos/Simple_Demo.zcos");

Change-Id: I23dfd5870043ce724a6a0b16061f4a1f0cc4604e

Slint: fix bug when mopen/mclose is not in a function's body

Change-Id: Iee1d3985aa5a4000d3010c23fc36053f9e700444

dlwIsExpress modified to avoid the use of regitry key

Change-Id: I850321775434e2e706c03283bcf742e8dfe90b0b

segfault fixed at Scilab exit

Change-Id: Ib68ec6b4a1c6b203956489c7a9d8d51915757677

[bug_14187] fscanfMat fixed

test_run fileio bug_14187
test_run fileio bug_6428

Change-Id: I339a9d81bcd5bc21c57a33da2eb41a6c724b4013

bug #14097: genlib does not add end separator

Change-Id: I1faff14deaacc3eb65ce532df658180730660173

* Bug #11511 fixed - error() did non accept string matrix (non regression test).

Change-Id: I78a88c36030001df5c226af9ccd858e322d982f6

bug_14212: unable to reload array of struct from scilab 5.5.2 sod file

Change-Id: I416c8a7a28ce147515a463591448690be9d3f70f

Xcos GUI: fix Annotations import and loosen DSTATE decoding

 * DSTATE can be an empty string, for backward compatibility
 * Does not handle all Annotations properties but now allows proper creation in the model

// Does not pass yet (need to decode all properties) but goes further
--> xcos(SCI + "/modules/xcos/demos/Simple_Demo.zcos");

Change-Id: Ie08cd0098cf523aefd9eb4abe3ee68299f7356c1

* Bug #13903 fixed - get_function_path() returned a path with a missing file separator.

Change-Id: Iece8626aed2982db4776d217d4ae7539c7965b5e

* Bug #14065 fixed - Change "java size" in points in graphics font help page.

Change-Id: I57c486f4ffe8901c86fd1a58aa72338ca10d0eca

Xcos GUI: minor Java code cleanup

Change-Id: I7974c96697ff43e7315a8a8905254a38fc42dcbc

Scicos src: fix struct detected as mlists

Change-Id: I9279dacb1eba577b378a377b9436d2e6aec8b5cb

Xcos: fix bugs when loading XCOS or ZCOS files

* Add an UID for Annotation, Link and Port
* decode link's inner ports
* manage duplicated id element (are invalid xml) PARTIAL FIX
* Render blocks well (size and flip)

Change-Id: I416782be9c73744fe082d2932ca396bf543018d2

Scicos src: var2vec: map encoding on sci_types instead of InternalTypes

 * Removed duplicate tests in xcos/ (they are in scicos/)

Change-Id: I4d22dfef90f4afc43976e1fe5213e87068671f94

Makefiles.in fixed about BLAS_CFLAGS

Change-Id: I21821e76e61b22e03eb22aaac31d224ac44f9824

reverted change for chroot architecture detection, it does not work (exclamation point cannot be used in a condition, without 'test' or '['), in fact

Change-Id: If8d9c2cc4b747ac8bd07829ebf73bcfcd582b83b

Scicos src: comment out Structs in var2vec

 * Because it is not mapped as a ScilabType (Xcos Java)

Change-Id: Ib9d571e23a768f88c81b076d78138a33bf21f3ce

Scilab launch script: support i386 chroot on a x86_64 host

In such a config, uname returns host values. The right thing to do is to
check long size using getconf.

Change-Id: If747cc628030e8dc8adb6c131281cb2828169355

Revert "Configure: detect Atlas on Fedora >= 21"

This broke the MacOS-X Jenkins build.

This reverts commit b20b2c72023f1e7599d8caf62a15bf04db978d40.

Change-Id: If20fbdbdb9bed3cb6848d049fcce54609a306963

Localization: regenerate locales

Change-Id: I69f710e161efd7e2163d9dbf307db7822fffdcba

Java tests: fix junit4 setup (by adding the missing Hamcrest jar)

Change-Id: Ia45c0c5ce3b267b0bbf880754aedfd118eb8ecc7

* Bug #14203 fixed - Improve some error messages, some help pages and some comments.

Change-Id: I3a92432fe9f892fd330f18ef115c1f0bb15f7834

Xcos MVC: handle XCOS / ZCOS file loading

 * Restore the scicos decoders for mixed file loading
 * Manage the mirror property on the Java side
 * Implement partial var2vec / vec2var to handle old diagram loading

Change-Id: I0cb4cb92ee9ea80629c43926c93ee11c7849c3ef

Xcos: reintroduce a private xcosDiagramToScilab

importXcosDiagram use this helper to decode files using the Java
implementation. The rationale behind : `importXcosDiagram` is a public
function that manage all supported file types whereas `xcosDiagramToScilab`
is an helper used to call the Java implemented decoders.

NOTE: This commit also slightly improve the decoding of XCOS and ZCOS
diagrams.

Change-Id: I3f7329194e728e60bce8b47033b28b77969a9002

Scicos src: fix memleaks

Change-Id: I10aa444cf142eb58230c675a865252882972840b

Configure: detect Atlas on Fedora >= 21

Change-Id: I37d5b951489328b04c71edbf8f59cb9626eddf99

Make doc: build on Java headless

Change-Id: If45574d61bd41d02835540e40da97a930688e2af

Xcos MVC: fix all cosf tests load and compile

See the out of source test file.

Change-Id: I68f9349ee6b08aafe3b940414f38e419c31d6131