Merge remote-tracking branch 'origin/master' into YaSp

Conflicts:
scilab/modules/fftw/src/c/fftw_utilities.c
scilab/modules/overloading/macros/%hm_prod.sci
scilab/modules/overloading/macros/%hm_sum.sci

Change-Id: I82b54e5c917e07e8637b561ddec9949fd0bcb038

Merge remote-tracking branch 'origin/5.5'

Change-Id: I229c7b1c948afb34dd944f0380c2dc25bd72c67b

checkstyle - removing RedundantThrows

Removed on the release 6.2
http://checkstyle.sourceforge.net/releasenotes.html#Release_6.2

Change-Id: I2e8f009da14146c7f5ed101606a69bcb15a0c374
(cherry picked from commit 713adeae49eb5a95c83877c32e3a5264d9a65f2e)

checkstyle - removing DoubleCheckedLocking

Removed on the release 5.6
http://checkstyle.sourceforge.net/releasenotes.html#Release_5.6

Change-Id: I3ce1c86ea417e644410a477ae2ba050c5011ed63
(cherry picked from commit 700de8be8a0339c94f9fca767fda17e08e63f4a9)

fix windows compilation

Change-Id: I1d88dbdcb7db388d15220a78faeb712775a8d989

Add specific tests realated to duplicate bug #10059

Change-Id: I77a1fd67ce12586358608be0a13d67d4fc0012fb

Analysis: always a WIP but we would expect that the end is nearer than the begin

Change-Id: I8d7a2ee6937950aa6d07caf51fb1677834bd8595

* Bug #12202 fixed - Mixing int8 and doubles with colon operator lead to wrong results.

Change-Id: I8f88f474f4b1d6299122ed3c95785b441ca1fd17

Add non-regression test for bug #10279.
No item added to CHANGES since never released.

Change-Id: I96748e6cccc06ea583b39c1338174056aa40a62c

Add non-regression test for bug #10056.
No item added to CHANGES since never released.

Change-Id: Ibd550b78065e63737e8cd8cbe390800034afabcd

Add new assert check

Change-Id: Ia5229c2d94518a4927644a0a0ea63b0aba55c5da

Add non-regression test for bug #9669.
No item added to CHANGES since never released.

Change-Id: I8427b8386e748e82f5a135b093717866d889c860

Add non-regression test for bug #9218.
No item added to CHANGES since never released.

Change-Id: I4061f956be42863c4f3a2020f1ef2a21c4fe73a9

fix bug 3287 ref

Change-Id: I646ea8a0846ff586844b7155073130eccff00a6e

Add non-regression test for bug #9600.
No item added to CHANGES since never released.

Change-Id: I1cb2c358755a9178a2286783734c36dd480cf80e

Add Scilab 6 generated files to .gitignore

Change-Id: I4a51c47db501b00c98645f7dea919cdeff919546

* Bug #13517 fixed - isdef crashed Scilab when called with a vector of strings
                     as input in a function and after a declaration of variable.
Fixed a long time ago, this commit only adds a non-regression test.

Change-Id: Ic1c6ef53a8c0f71f198c5577302a9cc26de09d4b

Fix example (See bug #13517)

Change-Id: I84b84260ac269478f87a90f408840c77fc2e5331
(cherry picked from commit 1745f01479ad93684fd15d8005b444d998767ade)

Fix example (See bug #13517)

Change-Id: I84b84260ac269478f87a90f408840c77fc2e5331

Fix Windows toolbox compilation

This reverts commit 55082a682eab6172472d243c5d03c9aad161cfcd.

Change-Id: I707596aafbd89645412d8b07874a2ea036ef7060

Scicos gateways: rewrite sci_diffobjs to C++

 * Tested by "scicos_blocks/tests/unit_tests/STEP_FUNCTION.tst", which crashed Scilab

Change-Id: I14bcfdeef47769d2688c05fc60bd87aa93a5bd5f

struct clone fixed.

* A struct cloned must have all SingleStruct reference set to 1
  because we cant increase reference of SingleStruct when we do it
  on a Struct.

z.y = 42;
y.o = z;

// here z is cloned, after extraction of z(1), two Struct
// contain the same SingleStruct with ref = 1 because of extraction without copy.
// When the temporary Struct "z(1)" is deleted, the SingleStruct is deleted too.
z(1).x=12;

Change-Id: I3b90752cdae7cdfe172bed30d8ad67959dc787f6

Xcos MVC: give default values to scs_m.props.options tlist for backward compatibility

 * Now the scicos tests that displayed a "Wrong diagram version" popup pass
 * Regenerated all the tests that had minor differences

Change-Id: I0044c64692397bc648f17a650307b3355ea99f1d

Revert "Fix Windows toolbox compilation"
Breaks dynamic_link under Linux: requires -std=c++11
Breaks dynamic_link under Windows: missing includes (SCI\modules\ast\includes\analysis\gvn\*.*) in binary version.

This reverts commit 7ada81d1ab54967b8208bb1933e519c1089087f4.

Change-Id: Iad4692c0654566d1c324eb18b14a27196e663b2d

* Bug #13866 fixed - There were some issues with FFTW3 library.
This bug was already fixed in YaSp branch: https://codereview.scilab.org/#/c/16244/
For more information, see: http://www.fftw.org/doc/New_002darray-Execute-Functions.html#New_002darray-Execute-Functions

Change-Id: Ia93a5cdf179ca1648f2db319f6d5db25673532a6

* Bug #13881 fixed - datatipRemoveAll did not work.

Change-Id: Idc29b1342ce9f5d8d9ba763f3277ddeab41c6ea6

Fix Windows toolbox compilation

Change-Id: If0785b256d01fc46f9240d20f289e3905d1ac97e

memory leak fixed in library management.

cd TMPDIR;
mputl(["function ret = lib_test";"  ret= ""lib1""";"endfunction"], "lib_test.sci");
genlib("lib1lib",TMPDIR,%f,%t);

Change-Id: I2dc68bb459d33e4f4246bc59e93d8d8583412b1d

AST: fix UserType display after https://codereview.scilab.org/#/c/16500/

 * -->loadXcosLibs(); scicos_diagram() could not display (or any other Scicos object)

Change-Id: I02035fffe755d31ea59a79bf828542d7183dc6d0

Xcos demos: add a Modelica demo to simulate a second order rotational system

 * Example from http://book.xogeny.com/behavior/equations/mechanical/

Change-Id: I757b8e17a1bf7a698b2d38209c6dd26b5e3074a0

Revert "Configure: disable Ubuntu/Debian specific flags"
Breaks GUI/graphics under Ubuntu 15.04:
figure()
  !--error 999
Scilab 'GUI' module not installed.

This reverts commit 01b41203f2879039653c1bc6119b6704ddf0abf1.

Change-Id: I28636a8662f46d23535a404f615d39ffa532e531

* fileinfo can now take a row vector as input.

Change-Id: Ice354cbef05e11f4ddb8bfbc8ad8826f7734dd9c

memory leak fixed in insertion.

a=12;
b=12;
// extraction od b(1,1) was never deleted
a(1,1) = b(1,1);

// argument colon was never deleted
a(:) = b;

Change-Id: I29144af5cda06ce9c4f5c317405c787412a0d53c

Windows command.temp EACCES error.

host start
1+1 // scilab crash because of NULL FILE* return by fopen

host start // then close window
1+1 // work

The process was created as inherit process of Scilab, so TMPDIR was locked by this process.

Change-Id: Iae0923e227c769f114d06b72ad03137fc5ddacde

Adapt test to Scilab 6:
 - include renamed
 - function returning nothing called with one output argument.
To test: test_run console bug_13226

Change-Id: I34b33fde5f59d6ddf4295615d7e398a60a0c291f

Fix quotes in .dia.ref

Change-Id: I3623d86e293cb3fb80e1ce5c12539879ce612ccb

Xcos MVC: remove the "Deleted" adapter

An mlist("Deleted") datatype is suficient and more natural to use for
temporary deleted objects.

Change-Id: I64d92a8f4a7b55e38db153a9be12762262ea771d

var calls like "a;" does not create local variable definition in scope 1 ( console )

-->%pi; // %pi level stay 0

function test()
    %pi; //create a local definition of %pi like %pi=%pi;
endfunction

Change-Id: I19a35cd59c0cf026f9b95dadae6434df0ae4f0e5

Fix quotes in .dia.ref

Change-Id: Ifba011a4819d8c172476fb38e088eb38f9948674

fix bug 3036 : stacksize no more in yasp

test_run("graphics","bug_3036",["no_check_error_output" ]);

Change-Id: Ie5ecfea5708423b310a43fad944af08cbd387e7f

fileinfo transposes intput matrix if it's not a column vector

cd(TMPDIR);
name = 'gw_example1';
table = ['sci_func1', 'func1'];
WITHOUT_AUTO_PUTLHSVAR = %t;
n1 = ilib_gen_gateway(name,table);
r1 = fileinfo(n1)

Change-Id: I8a03a4584f12fa9be3253cfcbc346956e2668fd0

delete test on save of variable in the lib

Change-Id: I74a93cc69bc68c979304cb441445ab12d35553b6

* Bug #13854 fixed - SciNotes did not initialize a new document at startup.

This commit introduce ScilabXPathFactory that enforce the use of the
OpenJDK provided XPathFactory. This ensure that loading saxon.jar or any
other XPathFactory provider did not interact poorly with Scilab usage.

Change-Id: Iffc5d7e79bd1dd1dc448c13f7536e04201d7b3d6

WIP jcompile did not report javac errors correctly

Change-Id: I6ecb88939a786bb59c4615b5c3e4c0425a4e2160

Configure: disable Ubuntu/Debian specific flags

These flags were used to avoid dependency on a recent glibc and thus
allow the binary release to run on older systems than the compilation
chain.

As the compilation chain now use the older system where a Scilab runs
such quirks are no more needed. Let distribution packagers perform their
own choices !

Change-Id: I15683378286ec2439483aafb838ca8c7996ea6cf

fix precedence of uminus in operation

M = matrix(1:4, 2, 2); B = [2; 4];
C = M^-1*B;
assert_checkequal(C, [2;0]);

Change-Id: Ia970740cf7c19d0605062a324175bd5df5055347

Xcos: do not create #identifier#identifier mxCell

When selecting multiple element on a diagram, it was possible to create
invalid identifier cells. This commit also include a cleanup at load
time to remove these invalid cells.

This commit fix the otrs#13058 bug.

Change-Id: I40b245f8df1138f84dd2e2273d3042581b417bbc

Fix get for colors property:
plot2d(1:10,1:10);
e=gce();
e.children

Change-Id: I6b2704035f374e895a1697f6f5a8bccdc5d94647

if the variable does not exist then an error message to indicate this

test_run("io","bug_11997",["no_check_error_output" ]);

Change-Id: I8e434ebe943dab0ee7781f0ebde56a9d8f60d047

%_sodload can recover the struct and cell data

Change-Id: I1203508b82fd8fb8a64693eafee6d582d692c35d

%_save can recover the struct and cell data

Change-Id: I7fe8491dc7e3a7898733342a160b2b86ff8fd226

Lexer: slightly improve double conversion

Change-Id: I3698a9df25d50a99ef29a3aba3b6ec93f8b4cdf5

Lexer: slightly improve strings & comments lexing

Change-Id: Ie9402e291fac2eba545c4b011923b843d54b0a64

don't see a UserType as a GenericType.

Change-Id: I9e29bfcad377041e6713504329e4166568b42397

Xcos demos: cosmetic changes for Heat conduction demo

 * Slightly improved the diagram layout and clarified the content of the Modelica block

Change-Id: I4c334a8ef09946fde6073c960f8af47328b82263

fix putInPreviousScope on libraries

Change-Id: I986c737e90b212c3912314ecadc23972f630cdf5

Installation
============

* Under Windows, MKL packages are now included in Scilab installer and no more
  downloaded while installing Scilab.

See https://codereview.scilab.org/16436

Change-Id: Iad7b0682382ec2516866b9819eaa8f5438fa663d

install: deploy MKL libraries from Scilab setup package (no download)

Change-Id: I5276a69e9107b8fa2014b34fd1402bbecc2a741f

use shortcut visitor in whileexp condition evaluation

Change-Id: I384038dcc77ff55307199740ce6bf15af9fd6c2b

Xcos demos: add a Modelica demo to simulate heat conduction in a rod

Change-Id: Ia7157e1ae9e3c8e9cd7ef7402a4f70dda1f42a9a

library removed from current scope.

Change-Id: I76d5827d36d588e0f74887db83b5011232f70d57

Scicos: fix getscicoslabel

 * Was missed in https://codereview.scilab.org/#/c/16483/ The test now passes again

Change-Id: I1552ee121eab0d845716f65d1d64b0bcc69f1831

Xcos: proper detection and handling of IFTHEL_f and ESELECT_f blocks

 * These blocks are treated separately from the others because they have negative simulation function numbers (-1 and -2),
meaning their actual simulation function is defined in scicos.c (see synchro_nev())

 * Commit https://codereview.scilab.org/#/c/15883/ removes the possibility of easily detecting these 2 blocks,
so 'funtyp' needs to be altered when a magic value is found

 * Demos "Simple demo" and "Discrete controller" serve as tests for this commit,
because they use a "freq_div" superblock which has an "IFTHEL_f" inside

 * Used magic values for the simulation function numbers to clarify them

Change-Id: I0d7a7c3a48f4ab18e0ac123422635ac2599e3b80

set_data_property "data" fixed, pvData used to know the real type.

plot3d(zeros(299,299));
e=gce();
e.data.z = e.data.z;

Change-Id: Ib353b2de22ec951a7c84510a68ccbeb668e20aa7

Fix heterogenuous string

Change-Id: I41975ea315436efb6bd9851af91264191c887aa0

fix bug on cell extraction

Change-Id: I2b5b98181d772043ef5309178809eefd6bc2b5ad

plot3d fixed after https://codereview.scilab.org/#/c/16264/

// should not return an error
plot3d(zeros(299,299))

Change-Id: Ifce97599d808697e66cbecf4073e24072233a535

plot3d fixed after https://codereview.scilab.org/#/c/16264/

// should not return an error
plot3d(zeros(299,299))

Change-Id: Ifce97599d808697e66cbecf4073e24072233a535

fix Windows compilation after scicos commits

Change-Id: I7bacf910b9ee76c27ec2eced241120215b20f997

Fix invalid read / write detected by valgrind

Change-Id: I6a073cf728882c74ee0e09606d64f2210a62d0b9

Fix Linux compilation after https://codereview.scilab.org/#/c/16214/

Change-Id: I8225ee5ceb5811f6463aa535872dbac27266f593

Scicos: var2vec now encode without copy

Change-Id: I311c38d141bf53445af69ab6953519a48f09af15

Xcos blocks: rewrite fromws_c to C++

 * Kept all the "fromws_c" names (instead of renaming to _cpp for backward compatibility)
 * Tests already present xcos/tests/unit_tests/fromws_c.tst & fromws_tows_c.tst, but cannot run yet because of importXcosDiagram()

Change-Id: I752d557106bd5c0a38da702d627a1c4a271f88da

Xcos MVC: fix includes

 * Added "utilities.hxx" to all files using 'ScicosID'
 * Added "charEncoding.h" to all files calling 'wide_string_to_UTF8'
 * Also fixed a compilation warning in scicos_log.cpp (unsigned int comparison with 0)

Change-Id: I86e8850eb9d5176f2c4554f7988a4510eec3796e

Xcos : rewrite sciblk2 to C++

Change-Id: If3d8f877e36a5d07ae24b1f8b0f3f48ebed89c9d

Xcos gateways: rewrite getscicosvars to C++

Change-Id: I99a8dc056bdd0075a3d95dcab3972d37ec5a318e

Xcos : rewrite model2blk, callblk and sciblk4 with C++ api

Change-Id: Idbe298eb6def71203792c9d96192320208de05fe

hasInvokeOption added in UserType to allow the use of optional input arguments.

Change-Id: Ib2f70b865c86a82fcf585c52bfcd1c900b04d7b8

Scicos: enable Structs for var2var and vec2var

 * Also enable them in the models (ModelAdapter.cpp)

Change-Id: I3f8180c0d575499c60487f99e3e87b3b28124873

Remove obsolete check_mac (inner function)

 * deff() now identifies syntax errors, so testing them with check_mac isn't needed anymore
 * Used by EXPRESSION block:
  --> loadXcosLibs();
  --> exec("SCI/test/xcos/EXPRESSION_en_US.cosf", -1);
  --> cpr=scicos_simulate(scs_m);

Change-Id: I55c943497d370c26c79e68581bd853ef5fdb246b

Xlist integrated in another Xlist need to be copied to perform  an affectation

example :
 value = mlist(["test", "NAMES", "VALUES", "DATE"], ...
    "a", ...
    ones(2,2), ...
    ones(2,2));

    data=tlist(["test", "DATA", "PT"], ones(4,1), value);

    test = data;
    data.PT.NAMES = "b" ;
    data.PT.NAMES
    test.PT.NAMES

Change-Id: Ia7c7b1bf1f5747f73300808a1833333ccc1f1b60

Tests deactivated because make test_run fail (parsing issue): will be fixed later.

Change-Id: Ifa9fafed9e36d5305c3db5ff19924dff694c4db9

Revert modification pushed by error (https://codereview.scilab.org/#/c/15725/), indent of Scilab files deactivated :(

Change-Id: I5799eae30824b28035f93f5923b133b880e68f0c

Tests deactivated because make test_run fail (parsing issue): will be fixed later.

Change-Id: I6e73d00169bc5d9f44348f67ad37a16085b13c81

Synchronize with YaSp branch version

Change-Id: I6801a3e78b5bd75e50be6e90fdefa396d5e394ad

Get this test back (removed by error when merging 'double' mondule into 'ast')

Change-Id: I68b3ff8639138a58ba8c0acb03adffac541e1cbc

macr2tree now works in YaSp branch

Change-Id: I64f1abc520a25d35f5199c9a42b483bf0750f46a

Synchronize tests with 5.5 branch

Change-Id: I3d2fa0a192efe8dd7d8528e983da12276ab82afe

Bug #13829 new fix + side effects of first patch fixed

Change-Id: I7a352dabbca480065f7cc46fac1251c6ffc32822

Revert "Manage load of deps for external_objects_java."
Already done in Java code.

This reverts commit 306d1549e04e3b01970e931223fc80c37285ff61.

Change-Id: Id9bbfba600fb1426203346189f3c5132a497423b

Move part related to mtlb_mode from listinsertion.tst to mtlb_mode.tst (set as not fixed for the moment).

Test:
test_run data_structures listinsertion

Change-Id: I829febc7b73d03ddead3860e410f399c06cbd5ca

 * Revert bug_5607.tst removal (https://codereview.scilab.org/#/c/11676/)
 * Set tests as NOT FIXED until mtlb_mode is implemented.

Change-Id: I1de3f9f9738f6680735cc59144ce41b6a65c4eed

Change error number 144 ==> 999

Change-Id: Ib4d8b16a6c6e4cf55453639f2d112f2e78b88520
Test: test_run integer bug_623

Manage load of deps for external_objects_java.

Change-Id: Ib683ae8f84991b30b1959950c8f59df327c0bfc1

fix bug 4675 test

Change-Id: If5d6dd1e603e63f6d45d6e3414318d276da11495

Removed tests using fun2string (removed function).

Change-Id: Iaed8834538883fe519b220966c6d6f2a3ca21861

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into YaSp

Conflicts:
scilab/modules/differential_equations/sci_gateway/fortran/sci_f_odedc.f
scilab/modules/differential_equations/tests/unit_tests/intg.dia.ref
scilab/modules/graphics/Makefile.am
scilab/modules/graphics/Makefile.in
scilab/modules/graphics/src/c/getHandleProperty/getHandleProperty.h
scilab/modules/mpi/Makefile.am
scilab/modules/mpi/Makefile.in
scilab/modules/overloading/macros/%hm_sum.sci
scilab/modules/scicos/sci_gateway/c/sci_data2sig.c

Change-Id: Ie2ec359732388de39d230cb2fe01f2e659c6bc26

fix bug 4834 test

Change-Id: I136f6ead8ea4fdfe6bcdf55000a7788e164d5965

Merge remote-tracking branch 'origin/5.5'

Change-Id: I1ff3668b0dc4b4bbb7a4cdb8e6995c3f9269914d

Update the javadoc comments to "JEP 172: DocLint"

Accordingly to the Javadoc team, the <br /> tag is not a valid HTML tag
and it will generate an error at javadoc build with a recent JDK.

Change-Id: Iae8fa8f2ea80a6da5938a0f5a70bb164d8da38a2