Xcos help: fix some duplicated id

Change-Id: I491735caef844f2bb238cd49c376f5438aa51539

Xcos: link Port as well as Link

 * tree_show(scs_m) showed only zeroes in Block.graphics.pin, pout, pein & peout

Change-Id: Ic543adfc8906efb7db44e2358031e7ec439a1dda

Xcos load: in mixed diagram case only decode the children once

Change-Id: Ie83f13b4c818ad63b5c5f00639f5dbc14170cc7f

Xcos writer: add the ordering attributes on the ports

Change-Id: Ic5a77ac502289eeec5dda6e5013d95f20301a3eb

Xcos: fix the tree_show calls

This commit also re-introduce the tree_show(`scs_m`) browser view as the
MVC browser is not ready yet.

Change-Id: If351ce5c105f943a7da1b4e790fb0555dc8309d3

Linux desktop: update appdata for gnome-software

Change-Id: Ie7f2f99c7f0788b7adc618da1219a0b483fe5148

update classpath following update of thirdparty

Change-Id: Icf97c6c024aff68539b765263367d92d362c837d

* Apache xmlgraphics stack upgraded to the latest versions :

  - xmlgraphics-commons 2.0.1
  - Batik 1.8
  - FOP 2.0

Change-Id: I29c091f9f779823a5a6a0a45869532bd7ca33359

Xcos java tests: update them for Xcos6

Change-Id: Ia462d9e02dc4e196321650c2f8fc3ac871eeac97

Xcos help: re-generate images

Change-Id: Ide07ca70a88d303aeb8e641a4b1da71376db2ec7

Xcos: reduce the lag at the first DnD

The first DnD of a block is laggy as the Java classloader have to load
Batik and most the Java2D stack while Dragging. We can limit this effect by
rendering a dummy style on a worker thread at Xcos startup.

Change-Id: I5037526a176960e602598242188cca53caebe8f0

Xcos: restore diagrams rendering on help pages

Change-Id: I7ec7cddf2f4952bd87800fd26c1a4be6a23bd180

Xcos GUI: enable Compile action

Change-Id: I21e4e2e51381cc3b17f42f126429219a0b4ef45a

Xcos files load: reduce the callstack and be backward compatible

All ".xcos" files (from 5.2.0 to 5.5.2) should load without producing any error.

Change-Id: I959c85e0cde43aaf210c4c9c6b964d33d6ed8a08

Help: fix the build after a9d9f4a46c2e299261cf8caa1e002a13a0cd2b04

Change-Id: Ib9c83554c65050a98a8d834451deb91a4f02c52d

* Bug #13298 fixed - Static analysis bugs detected by PVS-Studio fixed

Change-Id: I8dc4dbcb9c0b26b2e4934377f7149f6214504a75

Better help for (sg)et[default]language functions

Change-Id: Ifcaf077c26c517cf3f9fe03e3b6ec6e77c0ac745

[bug_14041] genlib fixed about locked file by another program

Change-Id: I763305e651871ed197309bdd98ab591711b629df

Configure: fix the arpack third-party detection

This commit only modify the way ARPACK is detected when using the
Prerequirements svn repository.

Change-Id: Ib3adaaf2f4b4f5e1cb50959c86fb3254a9faa460

Xcos MVC: use std::atomic to be thread safe

Xcos use both the Scilab execution thread, the EDT and the Finalizer Thread
to create / access / delete MVC objects. This commit manage this thread
safety using spin-locks implemented as std::atomic_flag (fast on the more
common threadsafe case).

Change-Id: Ic6ea51276de2a38e1530de6f08d138d4a04047e0

Xcos GUI: avoid a ClassCastException when something goes wrong

Change-Id: Id43d719dcb80e64f4bdb885cb97d477c2f7315f8

error displaying.

Change-Id: Ie78118ef40b4ad5767651ff83c37d8722ff00ccb

Scicos gateways: fix memory leaks

 * Detected by Coverity (CID 1321064 & 1321065)

Change-Id: I61ca53c37c6b577ca5158240d164feaccfc79501

* Bug #14178 fixed - tcl/tk unavailability on MacOS is now documented.

Change-Id: If8ee95fd9708df3b993e86a938a43500c98b08ac

bug 13986: setdefaultlanguage does not set value correctly in Windows registry

Change-Id: Ifd52bd85e9fa92dd551c690748300b3fc64f9059

* Bug #14181 fixed - Calling intg (or integrate) in a function that is being integrated failed

Change-Id: I6bb36e96191527e460ca5aa722e41bf9001c9b55

warning about redefinition of macro must be show only on same scope

function foo(), deff("g","");foo2();endfunction
function foo2(),deff("g","j");endfunction
foo() //must not show warning

Change-Id: Ifc92944b27c8bfe6d35f83999a9b0cf4ad84a0e7

Xcos refactoring: move link classes

There is only one class per kind of link ; moving them all to the same
package helps browsing the source code.

Change-Id: Ic677aac0f0160dfccd1d04efd192d35af4a09e3b

Xcos GUI: fix create a link from another link

The `linkKlass.newInstance()` method is not visible anymore on Xcos 6. We
have to create an MVC ID and then pass it to the constructor.

Change-Id: I1a0b07e63bb2cea4d2238a408cb346ed8742763d

Xcos decoding: manage mixed xcos files

Some Xcos / Zcos files store partially decoded sub-diagrams. This commit
manage such sub-diagrams contained into such a sub-diagrams.

After this conversion, the saved xcos / zcos files will contain
a complete XML representation.

Change-Id: Ia7dc4168405c8716c73c52461272b02c3117589d

Xcos vec2var: fix String and TList / MList

 * String encoding was invalid, the offsets were wrongly encoded
 * TList / MList had wrong size (header should be included)

Change-Id: I748949848302e2f34c8c91d0c88a886a236d0626

Xcos writer: fix an issue on List decoding

Change-Id: I094b0b836534aae380df58650fd4c0ffbae76936

Xcos I/O: decode more properties and store them

 * manage SuperBlock with an rpar MList (mixed schema)
 * add some properties
 * use the same ordering properties between handlers and writers
 * write the version comment at the beginning

Change-Id: I0ce3415039bb6331884fc9f3fdb2136ac51802d4

Xcos writers: fix ScilabString encoding

Change-Id: I1509fe9f9e3319a008f5adbe5e527e400b9412a5

Xcos writers: sort the children

Sort the children preserving their relative order to preserve the order of
the scs_m accross multiple load and save operations.

Change-Id: I33b209718c8ad90fb69f9cecdc6ecb7a649e22b3

Xcos writers: indent ".xcos" files

Change-Id: Ife0a0230dc7bb28fd2bd339fdb7155a9429b16b3

Xcos writers: add the "defaultParent" to the XML

Change-Id: Ib0ba685e20918ffd3215fff097845f5ab9e01672

Xcos decode: load list on xcos files

Change-Id: I420c5d0a9e20fc88402dec3693bd38d96c62e1e0

Xcos import: returns errors on error

Change-Id: I38203f8c330de6b77abca61fcb7aaad5aac8348e

Xcos: save and load the DEBUG_LEVEL

This property is now part of a diagram thus it should be saved as any other
property.

Change-Id: I88f830c3cc021526e0b67933a974061acb05c464

Xcos: launch a simulation

This commit also manage :
 * `scicos_new("0x2")` for Scilab calls from Java using a Java long
 * DEBUG_LEVEL as a model property

Change-Id: I1226b6ac0fd530304bfcca785ce5ee15f823386b

UMFPACK: fix some memory leak on normal case

Change-Id: I789b0bdeb1de9556a828b105e6ea5ac18b662fef

segfault fixed when bad SCI environment variable is setted when using call_scilab.

Change-Id: I7af8b9587f4c354a148a947245702d6715ec3f07

[bug_14253] Insertion in a struct contained in a list fixed.

Change-Id: I4ac4ceb9bafc679c82a22163bbb84c38012ce982

bug 13990: Windows installer does not ship all localization files

Change-Id: I8bb7dad8baceca96dfcecd8dc0fb7d9e40be7bcc

* Bug #14251 fixed - `spec` leaked some memory.

Change-Id: If59366cf3ed9c64782d1b87d63fb8798eb28e2cf

Xcos MVC: fix 'style' for Annotations

 * Treat Annotations like blocks so fill their 'gui' property (still nothing saved in the model though).

Change-Id: Iaa7714cc05fc3fe4dbc88c49ee030096e4b22eec

Bug 14257: Fixed English spelling in messages and in comments

Change-Id: I66f6bb2e1912fae98dbb90dcd6e4559cadd5816d

Better error message when error during doc generation

Change-Id: I03c98a27d5298d36511bf5b7752a14f7f11f0c51

Configure: reuse the same Java class to check #2

The `find -printf` is not available on Os X, this commit uses only
compatible behavior.

Change-Id: Ic410c9541f6b0714f2854c5f51f21ab9ee103e45

Configure: reuse the same Java class to check

This avoid the compilation time + execution foreach (java class * classpath
dir). It slightly improves the configure time for JAR dependencies.

On my machine, `time ./configure` returns :
 1m22.301s before
 0m29.333s after

Change-Id: I5ad28debb9d608367b9635f87ad613cded87ccdd

fix bug on s(f)grayplot after https://codereview.scilab.org/#/c/17405/

Change-Id: Ic00f0f273183599cf084dbaa6523e38caf8e08c9

Update localization

The script to dispatch the localization now handle the launchpad tarball
as an argument.

Change-Id: I2d068d160aaee42f50fd8f4ce6f89ed7aa68ca1f

FREE(str) when str is NULL crashed Scilab.
To test: Demos > Graphics > 2D and 3D plots > plot2d3

Change-Id: I31b1be349649a8df52979f77ddb66877c251424d

[bug_14225] Scilab binary return 1 when an error occured in scilab before exit. Return 0 in succesfull case.

./bin/scilab-cli -e "1+1;" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "1+1; exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch, disp(lasterror()),end" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch,disp(lasterror());exit(12), end" -quit;echo $?

test_run core bug_14225

Change-Id: I3af6be334934d42a1c0677db2a8e62e8d63d8eae

Complete overview and changelog, including in French

Change-Id: Ic531839d07654f55dfd793fda20387b09f30f114

Better names for coverage report

Change-Id: Ic6d74ef5314c559a9707d5941aded0a10b42ccd9

update changes to bug_12044

Change-Id: I14a23cb9fe8575a7e4bd9057996a4752f7cf1d6d

Xcos: save on the GUI and open block settings

Change-Id: Id3468d3d90e5d5f627e8c820bc91f3f934ed70ac

Xcos MVC: implement XCOS / ZCOS file saving

 * Add a DESCRIPTION property for blocks' value
 * Handle both binary and textual saving
 * testing is performed manually using xcosDiagramToScilab calls

Change-Id: If60686a54e87d6b127886d38592f93f9b0bd3ed3

add missing Makefile.in after https://codereview.scilab.org/#/c/17366/

Change-Id: Ia0478a9301a1b55628a8e27c587c1829f4f9738c

Adding or substracting the empty matrix now return an empty matrix

Change-Id: Ib2d41ea4fc44ea3624c849231c01f65aa49bd0c6

Configure: detect Atlas using pkg-config

Change-Id: Ibc050a69a02a902a448bd57df631398ec97728a3

* Bug #14232 fixed - Typo fixes

Change-Id: Ic7e098c3246d667ea0b0ff146fae93048bbe7dae

The initial mode value of ieee function is setted to 2.

Change-Id: Ie3c727863f7bb986e8678aaf9e729a30112c00bc

Java types: implement hashCode()

Change-Id: I3ae1c697b004331929828da231fbd6b132000730

bug_14204: fix swap of error messages in dec2base

Change-Id: Ice980d880897cb0373cf10fb927ed021b5ca052e

Scicos: getting the objs content crashed

Change-Id: I582b7d4a812cd867f5d9302644500c34af77b300

add coverage in Windows installer

Change-Id: I2ed8e398edc2079be03a5b1a782385e6d6c84c10

Do not default to static linking for libstdc++

1. dlopen-ed C++ library might not work
2. People using older libstdc++ / glibc can easily preload a backported
   version at Scilab startup
3. The compilation chain now targets an old glibc / libstdc++ (RHEL 5)

In depth, rationale :
http://www.trilithium.com/johan/2005/06/static-libstdc/

Change-Id: I22b15d791e945a04879dc6f4737310f2849e960e

remove cnes configuration files from Windows installer

Change-Id: I6eb54093933fdf0d3cb32e22509b66dab8545169

Slint: avoid crash when destination file can't be created

Change-Id: I32d12ab4332e0aee3b181fb742f56ba1b1229cc1

Cov: instrument correctly case exp

Change-Id: I4f6928e124fc14fe76bf91a620d71fa0ac21182a

SLint: remove all CNES code

Change-Id: I57a4f9869f0703424e4a7e1b1aa949182dcf8732

extract with ImplicitList fixed

test_run ast implicitlist

Change-Id: I26046e47279376bbcf572bc528cf18e8f0a9bbbb

operation 'or' fixed

test_run elementary_functions acosd
test_run elementary_functions asind

Change-Id: Ib622d321744afe4426637926e5c016eeb9bb2449

* Bug #14223 fixed - det returned an error when it is used with a singular matrix.

Change-Id: I69172b2c60bced9653955bac5d9d65206acde493

Xcos model: use vec2var encoding for EQUATIONS

Change-Id: I209dac0c8fa2aa71c3a84e599993dcdd615cf2e9

Xcos: remove std::nothrow dependency

This usage seems to break static-libstdc++ linkage for a unknown reason.
Remove them to pass the compilation chain.

Change-Id: I007ea82fab2f7b7d934bdb43390cdc0ad88e2105

fix bug after https://codereview.scilab.org/#/c/17413/

Change-Id: I48403d47e1da4a2588c60b2a9cb1fa0d18a35e67

a little speed improvement at call of C gateway

Change-Id: I8994e4c81cb82d9848eea136010533066a2b1c85

remove types_gw from Windows installer

Change-Id: Ia94244998a3261e9951352d616b87fd91a3bb592

coverage must be link staticly to scilab

Change-Id: I1db1bbf911384313b0aae4f8d2098d6375bb0f45

fix non handled exception if error occurs in scilab.start

Change-Id: Id491d15fecc4dcf65b1d679f142891e6fb8eeec5

add management of mode(7)

Change-Id: I5abfa67306e755522ed25a836cd603079ab5af03

Scicos src: vec2var now errors out on empty string/integer matrices

 * Empty string or integer matrices don't exist in Scilab, so error out when they are detected

Change-Id: Id32880df6de3e71cf436ce116884166e952c95de

Xcos MVC: Fixed objects content for compatibility between Scicos and Xcos

 * A superblock still contains children information but not the whole diargam anymore: it is regenerated on demand

 * Example to show that all model elements are cleared (here with SuperBlock):
 grep "objectCreated" tests/unit_tests/model/SuperBlock.dia.ref | wc -l
  = 83
 grep "objectDeleted" tests/unit_tests/model/SuperBlock.dia.ref | wc -l
  = 83

Change-Id: I89c82e65d05cc838b0e270b87d9ba90717ae6878

update "some" def files

Change-Id: I0856b4f36184cd60aaf5eba7e04db025235dcca9

re enable < indirection on command line under Windows

bin/scilex -nwni < file.sce &> output.log

Change-Id: Ie1aac79d7561b249e1da94746e21797a3951971c

memory leak in arrayof fixed

Change-Id: I0c5f421745ea3ef51128d1b9438dd4b28601ff65

move gateway about types from module types to core

  * fix scilab built with --wtout-gui flag

Change-Id: Iec72eeb4ebdafb0c51a801d4a7e0c0889dc29c5e

double delete of Library fixed

./bin/scilab-cli -profiling -e "loadXcosLibs" -quit &> log

test_run ast library
test_run ast library mode_nwni_profiling

Change-Id: I8e2bdafb275c65209588b515c2cc3b65b5aa703f

Add a code coverage tool

Change-Id: I1fbbef61b54db27deae6f70748ff492bdf463659

Scicos tests: fix default values and regenerate ref files

 * New property 'UID' and fix default values for 'exprs', 'odstate' & 'opar',
now that var2vec is mapped on sci_types

Change-Id: I1fa895fc06aef456a2be609873a5b37c9a28d4f5

Linux compilation fixed with --with-mpi flag

Change-Id: I8ebfd24fb9b47e7e221ed56a8581caac450d2018

* Bug #13931 fixed - handle "aarch64" processor for some Linux distribution.

Thanks to Martin Michlmayr for the patch.

Change-Id: Iae5bc7c8974be4c0c1034b47a43257a7358f355d

Xcos GUI: convert values only for scicos geometries

Change-Id: If4e8309bcffeccb58a901c8a51ec77a84a708ead

Xcos GUI: fix ZCOS reading

 * Some ZCOS files define ports twice, so only read them once.
Don't create a new object in the model but resync them.

// Positioning & sizes need to be fixed but the import passes!
--> xcos(SCI + "/modules/xcos/demos/Simple_Demo.zcos");

Change-Id: Ifc47aec6f83b72df151b79c5019f352ba5f6b900

Xcos GUI: fixed Annotations loading

// Does not pass yet but getting closer
--> importXcosDiagram(SCI + "/modules/xcos/demos/Simple_Demo.zcos");

Change-Id: I23dfd5870043ce724a6a0b16061f4a1f0cc4604e

Slint: fix bug when mopen/mclose is not in a function's body

Change-Id: Iee1d3985aa5a4000d3010c23fc36053f9e700444