Fixed the build following license changes

Change-Id: Ifa6addf09b5df72d5576664aad2b9f1255962216

GPL + CeCILL Header change

including COPYING file and other license files
Command below show non processed files
find . -type f -exec grep --files-without-match "=== LICENSE_END ===" {} /dev/null \; | xargs grep -li "cecill"

Change-Id: I0ce11528800e320d496ce18df15ed9e9042e958e

* Bug #14316 fixed - Operation scalar^matrix was identical to scalar.^matrix instead of being expm( log(scalar) * matrix )

Change-Id: Ie497c0effe3559eec686cb3b8edc9ea93fd15d1d

change order of tasks during scilab stop

 -> exec scilab.quit.
 -> exec modules.quit.
 -> close scopes (macros and gateways).
 -> unload dynamic libraries.

Change-Id: I1f9946b70e81ada38741606d8fccd6cb7b1f6438

Windows installer: add missing lib files in scicos_blocks

Change-Id: Idbe3c6d11ca0ce0692260aa8910784a818a5cb90

Improved test_run to fail when a test generates an error on create_ref or no_check_ref

Change-Id: I64dc914e6e46148ce83c6683466a517dd71f9f27

[Atoms] interactiv tests updated.

Change-Id: I00336d91bf4bc3c14e0a949abb7b4745327d4c5b

Update localization

Change-Id: I7218419ffcf2f1ba40c7b4ca8009402ce92e0408

Add the newsfeed files to the build

Change-Id: I9622682223c1e3d556db0eda4b67c3b5ed4cec0f

Allow building on 10.11 El Capitan

Change-Id: I6dc80d58914d5ca5569243d71ed14b59eb5fc098

Help ja_JP: fix duplicated xml:id after f26e5021

Change-Id: I0f4e097ba3b73c5944f89eb04fc7d5c022cba69d

dead lock fixed when the parser fails to open file

Change-Id: Ib3a9aef35d914ecb413797a821cf05f3922267ee

do not change legacy API prototype !

Change-Id: I69ceb433bee1b79d9681110ab9bfa9f8f2a9992d

call_scilab need good information about library path on Windows

Change-Id: I784902698380fa5347134ddb4191639bbd31caf0

Fixed merge mistake in previous commit

we don't support MacOS <= 10.8.3 anymore

Change-Id: I7736cee10b0ec594465c97411f27e94935acf5d7

Better startup script for MacOS 10.10 and 10.11 - don't tell the user it won't work when it will

Change-Id: Ifb86b0d52d217a66a5f8b12e855181b55925bb69

Compile: remove the non-standard malloc.h include

Change-Id: If98e863947cb18f6f44637dfe78b4ad3c40b0de9

Xcos help: fix duplicated id errors

Change-Id: Ief5ee2197501e5fb29b623fbad56dd90c32ff65a

f2c project fixed after https://codereview.scilab.org/#/c/17661/

Change-Id: Id98cba9d77c12d5ffce1306c638d0a1c7cc54955

linux compilation fixed

Change-Id: I65945e24def25bbb5add2f8f6fd75fcf0724c342

newsfeed: new URL, item content, status bar

Change-Id: Ia84392d724906c3fa0de300a89b4f206d9e000c0

newfeed: remove debug code

Change-Id: Ie6510130ce2448de5863f68824dbd77e0411acad

bug 14255 fix memory leak in fftw

Change-Id: Ie5b2f9fd405eb4f61c56d3a823cb47c17ba05982

fix 14249: ctrl-c can be used to stop writing control expression

Change-Id: Iaed3cdd25020fb9987690fbf61a2e1ef6ec762c6

fix some dynamic_link tests

Change-Id: I4657d992096b8eb0c2fd5720cb1e91c6a8b8cfaa

fix string module tests

Change-Id: I507494bb3599c1e4e0a7bc579e80e6984a627105

fix sparse module tests

Change-Id: Ie96a4152c0cc771aacf1891931853dd3b3e860ad

sfinit, bfinit, blkfc1, blkct, inpnv, symfct implemented

fix bug 6401 :
test_run("sparse","bug_6401",["no_check_error_output" ]);

Change-Id: I66f908720815bba64d0afe1e8578b2b256b981a5

[bug_14245] parser fixed about field and call

// error must be "undefined variable a"
a(1).b(2)(1:3)
a(1).b

test_run ast bug_14245

Change-Id: Iea193efe723ab87ec5b332b4e943a2ed448de3b7

parser rules print added for debug (and a few indentations)

Change-Id: I9c3274261d1cd1ab2347d88f0337c13e1d8246fb

Forbid creation of sparse matrix with sparse(hm)

Change-Id: Ia8e28cf9e21d8c96b22d4557b88ce9c6e2e0a6cd

Fixed tests in module io

Change-Id: I01c8ec7caf8bce20584c856dcc55a44c911a1f8a

atoms modules tests fixed

  * warning about operation and empty matrix
  * toolbox version updated

test_run atoms

Change-Id: I8ba5863df57aa1ce5f7adad0618ea17faed674e3

macro compilation fixed

Change-Id: I68eaac572e00e4dce3b1470db81ab0d58edb28e1

Scilab news feed
- integrated in GUI as flexdock panel
- displays RSS feed from scilab.org (configurable)
- displays one news at a time
- use HTML (JEditorPane/HtmlEditorKit) for display
- previous/next buttons
- possibility to change news automatically (time interval configurable).
- uses an external CSS stylesheet (ui_data/etc/newsfeed.css or SCIHOME/newsfeed.css)
- manages link opening in an external browser
- application & user settings in ui_data/etc/newsfeed.xml and SCIHOME/newsfeed.xml

Change-Id: I34d306655d153f29a6159af9951adb3ca396788d

Scicos: fix do_version before simulation

Change-Id: I3560d3cabff0135bb80babf8132ec26015fee33c

Scicos: enforce override and final specifiers

Change-Id: I18b46b94dfcf6f9d94d6d164fed1bea073fb3d33

remove useless filesep in genlib

test_run functions bug_12593

Change-Id: Id70e6efcd688b8dd395b91bfcd0ae855a38bba92

warning about redefining function fixed

test_run ast bug_13919
test_run functions bug_1469

a=1;
function a(), end

Change-Id: Icfb02480fb83e18fbb6d3ba9f9cd56048eb2c9b1

avoid the use of api_scilab isScalar with intel compiler

Change-Id: Ifb86bddf7d4b915399d02152c5cc7bd91647fe9d

memleak fixed in SeqExp about ifstream

test_run("ast",[],"mode_nwni_profiling")

Change-Id: I34634f3632e31b76e3d586ba8461a880a3ec866e

execstr fixed about parser error

Change-Id: I1692b6e5ca43593a15924d39aaac33b0bef859d6

implicitlist test fixed about localization.

Change-Id: I9492e7304cc31e5293cde4a77a375b2682eeda1b

location fixed with unary minus in a matrix expression.

test_run ast displaycomplex

put in a file a matrix like :
[1 2 3;
4 5 6;
7 8 -9]

exec("file", 1)

Change-Id: Ibbefed71c65c740179d2e77c385590d63ead87ad

* Bug #14313 fixed - Parser did not create a column separator after spaces and '...' at the end of line

Change-Id: I184af053472254beb7cb39a2392e954b27b420eb

Xcos load: load mixed diagrams with modelica blocks

Change-Id: I7b17c5b27755b5db0678bac3578326e8fa630851

fix det for singular matrices

Change-Id: If4c3fb532fbe718a51128ba1b19b065636087841

Localization : update the translated strings

Change-Id: Iacbe0839af1a62bd47f6e85f9e220d57847af3bb

Java types: swig update after f26e5021

Change-Id: Icb5207ab59af73102f56b2383971fc4801e040c5

[bug_14096] msscanf fixed about the %s switch to %ls

Change-Id: Iffd12f36aebc9b4188dc20d331881109496ea757

update mode management

Change-Id: Ice12edf6b2f4a7152d84ae017bd738fce1396f94

xcos: first pass at changelog for Scilab 6.0.0 beta 1

Change-Id: I83258045f1960d5c6eaf7833a923857e5cea5b84

ast: fix a warning on almost all types

Change-Id: I9449df2b8050a710c2f7bcd1a98f4259f80cc510

Update the pkg-config file

Using call_scilab might be easier using pkg-config. We auto-magically setup
the produced binary rpath.

    gcc -o foo.o -c foo.c $(pkg-config --cflags scilab)
    gcc -o foo foo.o $(pkg-config --libs scilab)

Change-Id: Ic5dfef30334f7a779060015c8b82d2751c366ddd

ui: bug #14299: use stricter 6.0 syntax for menu scripts

Change-Id: I0b3ee52fcb42b59d783460898af5ac0dd39718b0

./configure --enable-debug FLAGS cleanup

The '-Wall -Wextra' will set common global warnings.

Change-Id: I48039e7d24be3c797fe748abef5724eab972494b

Scicos: minor cleanup to re-use existing lock/unlock methods

Change-Id: Icfc343a87071f5e376c814f43e5525d90051b841

the return of call

Change-Id: I12f3c031df56f32bb7ce87ec98731f35d15a64c6

make api easier to use

Change-Id: I904b749fb0883cdb9b8f8d6cf4837360649a253c

Xcos load: re-implement ordering for mix-saved XCOS / ZCOS files

Change-Id: If6a2ebf63eb8f68dfed06325f6751f06c6ad350c

ged and object editor unavailabilities on MacOS is now documented.

Change-Id: Ie22266d0cf0cee05f4f27d9e8c9195a6be076bc6

Happy new year 2016

Change-Id: I393f1a7b0ed38a3eae2a1bb8cb7c4fd9f483733e

Indentation hooks: allow XMLINDENT and ASTYLE pre-set

To disable the indentation hooks for only a specific commit, you can now
use :
 $ XMLINDENT=/bin/true git commit
or
 $ ASTYLE=/bin/true git commit

Change-Id: If09f32336fece63de1e473bbbb19b7e450a92ed5

./configure --without-jdk PASS

Saxon was previously checked to build the PDF documentation. This commit
disable it by default if the without jdk option is explicitly set.

Change-Id: I95b8d83a090d56e122dc9917a1ead6adca4c4847

ast types::subtraction used to call overload on eye() - sparse([1 2; 3 4]) operations

Corrected dia.ref to take into account empty operations with operation-
Changed set(x, y, value) to set(x, y, value, false) and finalize on
sparse matrices (from commit https://codereview.scilab.org/#/c/17282/11)

Change-Id: Ie103b6f010868cb437d0d4e00fc8b5e68f8fab4b

Xcos: fix the DSUPER preference over SUPER_f

Change-Id: I16cd8013fd2f73e66d70947024d676ba0b0be4a9

Help: fix the duplicated IDs

Change-Id: I49be43a22b9f82aeecb09ddf6e76dcd24dec0e42

Scicos: fix some C++ warnings

Change-Id: If44448f80c14b0aa3bedaea48c2024778573afa3

Windows compilation fixed

Change-Id: Ia0d1a2486ebf7195f91e65c1b886f1e37adcec54

Xcos GUI: cleanup Java code

Change-Id: I7111b75b3e95024eb8199fbd17b7c10f88b083a5

Test corrections on modules for operation+ and operation- with empty matrix

module preferences to module xml

without modules xcos, scicos and scicos block

Change-Id: Ic8392f0e53aecc8bb42d05b266dc1b4d29c243f1

Xcos GUI: define our own GraphModel

On Scilab 5.5 the ID creation were performed on cells but moving it to the
model is much more easier to manage on load / reload.

Change-Id: Ieb22e4543ec76eaa0b815107d22a4cd846c6f98a

Xcos: fix port orientation

Change-Id: I7ef471cdb0011cf22f61f988fcbcb6aee2a26a56

XCOS and ZCOS format : cleanup the format

 * Store valid matrices content
 * Share code for ZipEntry setup for all ZCOS Entries
 * Avoid storing '\n' on the XML as they will be discarded on reload

Change-Id: I18dbb58bbb5e3040862028866207392f88c3b303

Xcos MVC: check parentBlock before parentDiagram

 * All objects reference the root diagram, but superblocks elements reference their parentBlock

Change-Id: Ib2c99d92ed58a6e85986f191da38753746df886f

Localization: update POT and fix some PO

Change-Id: I6ed0298ec7ef2cca04af51289a49105765c33cf0

Xcos MVC: fix diagram cloning

 * Generate the adapters chain when it is absent
 * Mainly used by Xcos GUI's Compile & Start actions, so simple simulations now pass! (Superblocks don't work yet)
 * Scicos tests: only Deep_cloning was really affected (only place where a Diagram was cloned at model-level)

grep --include=Deep_cloning.dia.ref "objectCreated" -r | wc -l #151
grep --include=Deep_cloning.dia.ref "objectDeleted" -r | wc -l #151
grep --include=Diagram_cloning.dia.ref "objectCreated" -r | wc -l #33
grep --include=Diargam_cloning.dia.ref "objectDeleted" -r | wc -l #33

Change-Id: Ib41dce8c02a3851666b73ea89bb21edce9271735

api_scilab include missing after make install

Change-Id: Icbb6e6e7006674db01112ca2c17625f94fb96570

[bug_14300] double free fixed

test_run ast bug_14300
test_run ast bug_14300 mode_nwni_profiling

Change-Id: I87da365586b456224e4b6929b7ac064e54c92e8d

Xcos file format: fix some issues on read-write

 * a typo on Port labels
 * Store matrices as vectors on the MVC in a scilab way
 * Store the Scilab timestamp as the default time
 * Only set PARENT_BLOCK if needed

Change-Id: Ifa909881466445c2d473d55872f254a1e7623cf7

Xcos load: restore split position after cad91838

Change-Id: I25dbf22adcf17692d9e31962925f0a9f2e23c5da

fix addition of "a=eye() * %s;a + %s;a"

Change-Id: I5f74121b5e535b6f12bb4a03f1f10821dcae8b41

Xcos: refactoring of constructor-chain

Passing all possible arguments will setObjectProperty only once and at
allocation. It will be far easier to debug and trace things.

Change-Id: I2daeed9cf707c16099c2fbacdf9eb1b73ed079d4

Xcos: remove the checked FIXME on the code

Change-Id: Ie1760be2012cdfeaba57508883e6f73c8cd79fdb

Xcos: load and save all known xcos files

Change-Id: Ib879e6d3f7d5e126a46ddc44a25f4c6e57e7c5d5

Update the forgotten copyright headers

Change-Id: I792030386a6f5fa12a48a754ecab2a7988659390

Attack of the Clones

 * check types ref before modify it
 * use more polymorphism stuff
 * clone return this type instead of InternalType

Change-Id: I1a267a1eabc5b8a40592c7292c37cf7fcdedb072

Analysis: Add DollarInfo, VarPromotion, and move var clone at the right place when it occured in a loop

Change-Id: Ie1449ef530f9369f3076d3b6cac2a1193126fffb

Xcos: load/save should preserve UID values

Change-Id: Ib0deb52dc244cb915f7813aa8d28ea12b96e660d

Xcos: ZCOS should not store the time

Change-Id: I9da0a198a1924ce6f0d414b9500c3760958069d4

Xcos: put ANNOTATION at the end on sortAndFill

On saved files, the objects are sorted per kind. It is much more easier to
get the blocks first while debugging content. As the sorting is only
performed on the enum value, moving it will perform the job.

On the Xcos GUI and as the ANNOTATION will be decoded after the block, they
will appears "on top" of the BLOCK and LINK objects which is expected.

Change-Id: I966d4229e79f44021c416334c0105b30f894a7cb

Xcos load: do not duplicate children

Change-Id: I169e431de5e1cad290f31203512e7a72bb53ae84

Xcos GUI: update the Tab title on save

Change-Id: Id49fc6e63e503feffc53411c309025a7eb5b3fbe

Xcos GUI: implement "Region to Superblock"

Change-Id: I4dbd52ade5f4f945c11d82baeaf481f2e8cc9a4f

Scicos: fix the "" + [] and 1 + []

Change-Id: Ifa4e6b58fac424d79f7b95555f50d0bf8e3b549a

New C API for Scilab gateways (once again ...)

2 modes:
  - "safe" version, good for development phase
  - "unsafe" version, remove checks in API for better performance and nice
    crashes

Standard calls use "safe" version, to use "unsafe" version
define __API_SCILAB_UNSAFE__ before include of "api_scilab.h"

Done:
  - common, double, string, int, struct, cell, polynomial,
    boolean, (_/t/m)list, graphic handle, optional.
  - update dynamic_link gateway builder to link the new interface
  - add overload and call function capability.
  - add somes tests in api_scilab
  - add some help pages ( double, string, interger, struct, boolean, poly,
    cell, list, tlist, mlist, pointer )
    .
Not done yet:
  - sparse.
  - lot of tests in both mode.
  - help pages ( sparse )
  - add some helpers on configvariable for exemple ( getMode,
    getScilabMode, getOS, getWarningMode, getSCI, getTMPDIR, getSCIHOME, ...
    )

Change-Id: I15b9912842326b41353bd002b8876cf7246a4884

Test corrections on module for operation+ and operation- with empty matrix

action_binding to polynomials
grep for WARNING_EMPTY_OPS on test files to remove warning("off") once the
warning on operation+ and operation- are removed from scilab
without core

Change-Id: I8df147f450e8c173a5c0fb96f8d551d318cb3d77

Bug 14193 fixed: Problem with matrix defined in a matrix of structs

Change-Id: I6e7b99cdcc646df832b07afc1b9889957b61201a

typo fix

Change-Id: I2b30402aa5fc73f002d8d7877e18d807e424648e

Xcos save: generate uniques but predictables UIDs

This commit allow reproductible edit / save cycles without dummy
modification. This allow the use of a VCS to track modification.

Change-Id: I5edb08038e3b08cb7e996e14a9d65d4195d4166e