Xcos GUI: update the Tab title on save

Change-Id: Id49fc6e63e503feffc53411c309025a7eb5b3fbe

Xcos GUI: implement "Region to Superblock"

Change-Id: I4dbd52ade5f4f945c11d82baeaf481f2e8cc9a4f

Scicos: fix the "" + [] and 1 + []

Change-Id: Ifa4e6b58fac424d79f7b95555f50d0bf8e3b549a

New C API for Scilab gateways (once again ...)

2 modes:
  - "safe" version, good for development phase
  - "unsafe" version, remove checks in API for better performance and nice
    crashes

Standard calls use "safe" version, to use "unsafe" version
define __API_SCILAB_UNSAFE__ before include of "api_scilab.h"

Done:
  - common, double, string, int, struct, cell, polynomial,
    boolean, (_/t/m)list, graphic handle, optional.
  - update dynamic_link gateway builder to link the new interface
  - add overload and call function capability.
  - add somes tests in api_scilab
  - add some help pages ( double, string, interger, struct, boolean, poly,
    cell, list, tlist, mlist, pointer )
    .
Not done yet:
  - sparse.
  - lot of tests in both mode.
  - help pages ( sparse )
  - add some helpers on configvariable for exemple ( getMode,
    getScilabMode, getOS, getWarningMode, getSCI, getTMPDIR, getSCIHOME, ...
    )

Change-Id: I15b9912842326b41353bd002b8876cf7246a4884

Test corrections on module for operation+ and operation- with empty matrix

action_binding to polynomials
grep for WARNING_EMPTY_OPS on test files to remove warning("off") once the
warning on operation+ and operation- are removed from scilab
without core

Change-Id: I8df147f450e8c173a5c0fb96f8d551d318cb3d77

Bug 14193 fixed: Problem with matrix defined in a matrix of structs

Change-Id: I6e7b99cdcc646df832b07afc1b9889957b61201a

typo fix

Change-Id: I2b30402aa5fc73f002d8d7877e18d807e424648e

Xcos save: generate uniques but predictables UIDs

This commit allow reproductible edit / save cycles without dummy
modification. This allow the use of a VCS to track modification.

Change-Id: I5edb08038e3b08cb7e996e14a9d65d4195d4166e

Xcos GUI: implement SuperBlock masks

Change-Id: I3c488624aadc2ca4c4767d6abfe4a8938c080082

return(x) without assignation is not a correct expression

Change-Id: I05a52b7b029bd916bc4788c0f9d203323c4fefa3

fixed the internal commit hook to work on Mac also.

mktemp takes different argument on Linux and Darwin (BSD)

Change-Id: I341532fae8331d9f37ea769bfa6a03eb5e8b61fc

Fix for bug 14290: never set java.awt.headless to true on Mac

Change-Id: If20cd6ef45a51d57148233b72022a389616fabb1

Xcos GUI: implement modelica initialization

Change-Id: I50b7c12801850f70e1d5ad51e79097e297668726

Xcos GUI: cleanup Java code

 * Also fixed a typo in the jni file
 * Used JavaContoller's lookup_view instead of Controller's look_for_view in ContextUpdate.java

Change-Id: I5a8ab25e884a10503c0ec41c305b8fec1f6797fa

Xcos MVC: update tests and log DEBUG_LEVEL

 * Added DESCRIPTION and DEBUG_LEVEL properties to the tests ref files

Change-Id: Idd2ec469c25ec137a5a4cfb9bbec8dd73e32f130

Xcos MVC: restore message printing

 * Locking the model only when consulting/editing it
 * https://codereview.scilab.org/#/c/17500 introduced regression (run Scicos tests)

Change-Id: Ib95aae0e7266a24004ffbe0d9db518e660296e93

fix find with 2 args after https://codereview.scilab.org/#/c/17216/

Change-Id: Ie94e400e4fe2db3c4f3401f734a3b51b7d33753b

bug 13918: Unmanaged operations on hypermatrix did not call overload functions.

Change-Id: Iedcdf178b749d0663228a476867aa2546d201dc1

Empty matrices operation: added a warning to + and - operations

Added a warning flag to stop execution and thus retrieve the lines where warning occurred

Change-Id: Ied0b82272758e756d842abca4834246f8a9e0495

debugger:

- avoid add duplicate breakpoints.
- if disp command failed, error is correctly displayed in console.
- update help pages.

Change-Id: I58e37f2d06c4da830d7da5df7b26ab09b5831741

* Bug #14219 fixed - As bug #14203, improve some error messages, some help pages and some comments.

Change-Id: I75d7251c729cd0a295625ff9a2af398e2c439981

Git: ignore NetBeans IDE generated project

Change-Id: I843d3f980e7ae2e22ca3cfe4cab648a217536d07

Xcos GUI: validate the context after edit

Change-Id: Ia3787251ab46f9b81a8fa1311c0aa3f6f8121b50

Xcos GUI: snap split blocks on the grid

Change-Id: Ib67c58d4da2f4cc953b7ab15f881ced1050a6fc3

* Bug #14228 fixed - Setting rotation_angles property to a matrix of any size did not return error message.

Change-Id: I2d0b64ff019ae099e8cb0f9d2cddb148bf0e45b7

Xcos GUI: fix some graphic artefact

 * Handle ANNOTATION value on loading
 * Implement a convertion for custom exprs (used in block labels)

Change-Id: If7e15b326a61740b032d2c438b9cf417408af3b4

* Bug #14043 fixed - Examples of api Scilab help pages had to be updated (pvApiCtx in gateway prototypes).

Change-Id: I9b6dec63d7258d633a7b2f3bc4d5a1c80fcd5c65

Xcos: de-duplicate ports on loading and DnD

To avoid duplication of ports we have to implement JGraphX `removeFromParent`
method. This method will be used to remove before add any XcosCell.

Change-Id: I12cd37971f7c67112d705aff59415a19a5328767

Xcos GUI: restore some graphical helpers

 * restore the "*" visual on modification
 * render the exprs accordingly to "displayedLabel"

Change-Id: I7edbf72d848494b23eaad93ee7c5afeee749467a

fix windows installer generation

Change-Id: I19cc3416e6a4d01edc7eb1fb7bd6ed14e1d5d62b

Doc: handle anchor tag and check for doubloons

Change-Id: I3f58482e2f4373557bfab32f4e97344dc8eea9c4

Xcos help: fix some duplicated id

Change-Id: I491735caef844f2bb238cd49c376f5438aa51539

Xcos: link Port as well as Link

 * tree_show(scs_m) showed only zeroes in Block.graphics.pin, pout, pein & peout

Change-Id: Ic543adfc8906efb7db44e2358031e7ec439a1dda

Xcos load: in mixed diagram case only decode the children once

Change-Id: Ie83f13b4c818ad63b5c5f00639f5dbc14170cc7f

Xcos writer: add the ordering attributes on the ports

Change-Id: Ic5a77ac502289eeec5dda6e5013d95f20301a3eb

Xcos: fix the tree_show calls

This commit also re-introduce the tree_show(`scs_m`) browser view as the
MVC browser is not ready yet.

Change-Id: If351ce5c105f943a7da1b4e790fb0555dc8309d3

Linux desktop: update appdata for gnome-software

Change-Id: Ie7f2f99c7f0788b7adc618da1219a0b483fe5148

update classpath following update of thirdparty

Change-Id: Icf97c6c024aff68539b765263367d92d362c837d

* Apache xmlgraphics stack upgraded to the latest versions :

  - xmlgraphics-commons 2.0.1
  - Batik 1.8
  - FOP 2.0

Change-Id: I29c091f9f779823a5a6a0a45869532bd7ca33359

Xcos java tests: update them for Xcos6

Change-Id: Ia462d9e02dc4e196321650c2f8fc3ac871eeac97

Xcos help: re-generate images

Change-Id: Ide07ca70a88d303aeb8e641a4b1da71376db2ec7

Xcos: reduce the lag at the first DnD

The first DnD of a block is laggy as the Java classloader have to load
Batik and most the Java2D stack while Dragging. We can limit this effect by
rendering a dummy style on a worker thread at Xcos startup.

Change-Id: I5037526a176960e602598242188cca53caebe8f0

Xcos: restore diagrams rendering on help pages

Change-Id: I7ec7cddf2f4952bd87800fd26c1a4be6a23bd180

Xcos GUI: enable Compile action

Change-Id: I21e4e2e51381cc3b17f42f126429219a0b4ef45a

Xcos files load: reduce the callstack and be backward compatible

All ".xcos" files (from 5.2.0 to 5.5.2) should load without producing any error.

Change-Id: I959c85e0cde43aaf210c4c9c6b964d33d6ed8a08

Help: fix the build after a9d9f4a46c2e299261cf8caa1e002a13a0cd2b04

Change-Id: Ib9c83554c65050a98a8d834451deb91a4f02c52d

* Bug #13298 fixed - Static analysis bugs detected by PVS-Studio fixed

Change-Id: I8dc4dbcb9c0b26b2e4934377f7149f6214504a75

Better help for (sg)et[default]language functions

Change-Id: Ifcaf077c26c517cf3f9fe03e3b6ec6e77c0ac745

[bug_14041] genlib fixed about locked file by another program

Change-Id: I763305e651871ed197309bdd98ab591711b629df

Configure: fix the arpack third-party detection

This commit only modify the way ARPACK is detected when using the
Prerequirements svn repository.

Change-Id: Ib3adaaf2f4b4f5e1cb50959c86fb3254a9faa460

Xcos MVC: use std::atomic to be thread safe

Xcos use both the Scilab execution thread, the EDT and the Finalizer Thread
to create / access / delete MVC objects. This commit manage this thread
safety using spin-locks implemented as std::atomic_flag (fast on the more
common threadsafe case).

Change-Id: Ic6ea51276de2a38e1530de6f08d138d4a04047e0

Xcos GUI: avoid a ClassCastException when something goes wrong

Change-Id: Id43d719dcb80e64f4bdb885cb97d477c2f7315f8

error displaying.

Change-Id: Ie78118ef40b4ad5767651ff83c37d8722ff00ccb

Scicos gateways: fix memory leaks

 * Detected by Coverity (CID 1321064 & 1321065)

Change-Id: I61ca53c37c6b577ca5158240d164feaccfc79501

* Bug #14178 fixed - tcl/tk unavailability on MacOS is now documented.

Change-Id: If8ee95fd9708df3b993e86a938a43500c98b08ac

bug 13986: setdefaultlanguage does not set value correctly in Windows registry

Change-Id: Ifd52bd85e9fa92dd551c690748300b3fc64f9059

* Bug #14181 fixed - Calling intg (or integrate) in a function that is being integrated failed

Change-Id: I6bb36e96191527e460ca5aa722e41bf9001c9b55

warning about redefinition of macro must be show only on same scope

function foo(), deff("g","");foo2();endfunction
function foo2(),deff("g","j");endfunction
foo() //must not show warning

Change-Id: Ifc92944b27c8bfe6d35f83999a9b0cf4ad84a0e7

Xcos refactoring: move link classes

There is only one class per kind of link ; moving them all to the same
package helps browsing the source code.

Change-Id: Ic677aac0f0160dfccd1d04efd192d35af4a09e3b

Xcos GUI: fix create a link from another link

The `linkKlass.newInstance()` method is not visible anymore on Xcos 6. We
have to create an MVC ID and then pass it to the constructor.

Change-Id: I1a0b07e63bb2cea4d2238a408cb346ed8742763d

Xcos decoding: manage mixed xcos files

Some Xcos / Zcos files store partially decoded sub-diagrams. This commit
manage such sub-diagrams contained into such a sub-diagrams.

After this conversion, the saved xcos / zcos files will contain
a complete XML representation.

Change-Id: Ia7dc4168405c8716c73c52461272b02c3117589d

Xcos vec2var: fix String and TList / MList

 * String encoding was invalid, the offsets were wrongly encoded
 * TList / MList had wrong size (header should be included)

Change-Id: I748949848302e2f34c8c91d0c88a886a236d0626

Xcos writer: fix an issue on List decoding

Change-Id: I094b0b836534aae380df58650fd4c0ffbae76936

Xcos I/O: decode more properties and store them

 * manage SuperBlock with an rpar MList (mixed schema)
 * add some properties
 * use the same ordering properties between handlers and writers
 * write the version comment at the beginning

Change-Id: I0ce3415039bb6331884fc9f3fdb2136ac51802d4

Xcos writers: fix ScilabString encoding

Change-Id: I1509fe9f9e3319a008f5adbe5e527e400b9412a5

Xcos writers: sort the children

Sort the children preserving their relative order to preserve the order of
the scs_m accross multiple load and save operations.

Change-Id: I33b209718c8ad90fb69f9cecdc6ecb7a649e22b3

Xcos writers: indent ".xcos" files

Change-Id: Ife0a0230dc7bb28fd2bd339fdb7155a9429b16b3

Xcos writers: add the "defaultParent" to the XML

Change-Id: Ib0ba685e20918ffd3215fff097845f5ab9e01672

Xcos decode: load list on xcos files

Change-Id: I420c5d0a9e20fc88402dec3693bd38d96c62e1e0

Xcos import: returns errors on error

Change-Id: I38203f8c330de6b77abca61fcb7aaad5aac8348e

Xcos: save and load the DEBUG_LEVEL

This property is now part of a diagram thus it should be saved as any other
property.

Change-Id: I88f830c3cc021526e0b67933a974061acb05c464

Xcos: launch a simulation

This commit also manage :
 * `scicos_new("0x2")` for Scilab calls from Java using a Java long
 * DEBUG_LEVEL as a model property

Change-Id: I1226b6ac0fd530304bfcca785ce5ee15f823386b

UMFPACK: fix some memory leak on normal case

Change-Id: I789b0bdeb1de9556a828b105e6ea5ac18b662fef

segfault fixed when bad SCI environment variable is setted when using call_scilab.

Change-Id: I7af8b9587f4c354a148a947245702d6715ec3f07

[bug_14253] Insertion in a struct contained in a list fixed.

Change-Id: I4ac4ceb9bafc679c82a22163bbb84c38012ce982

bug 13990: Windows installer does not ship all localization files

Change-Id: I8bb7dad8baceca96dfcecd8dc0fb7d9e40be7bcc

* Bug #14251 fixed - `spec` leaked some memory.

Change-Id: If59366cf3ed9c64782d1b87d63fb8798eb28e2cf

Xcos MVC: fix 'style' for Annotations

 * Treat Annotations like blocks so fill their 'gui' property (still nothing saved in the model though).

Change-Id: Iaa7714cc05fc3fe4dbc88c49ee030096e4b22eec

Bug 14257: Fixed English spelling in messages and in comments

Change-Id: I66f6bb2e1912fae98dbb90dcd6e4559cadd5816d

Better error message when error during doc generation

Change-Id: I03c98a27d5298d36511bf5b7752a14f7f11f0c51

Configure: reuse the same Java class to check #2

The `find -printf` is not available on Os X, this commit uses only
compatible behavior.

Change-Id: Ic410c9541f6b0714f2854c5f51f21ab9ee103e45

Configure: reuse the same Java class to check

This avoid the compilation time + execution foreach (java class * classpath
dir). It slightly improves the configure time for JAR dependencies.

On my machine, `time ./configure` returns :
 1m22.301s before
 0m29.333s after

Change-Id: I5ad28debb9d608367b9635f87ad613cded87ccdd

fix bug on s(f)grayplot after https://codereview.scilab.org/#/c/17405/

Change-Id: Ic00f0f273183599cf084dbaa6523e38caf8e08c9

Update localization

The script to dispatch the localization now handle the launchpad tarball
as an argument.

Change-Id: I2d068d160aaee42f50fd8f4ce6f89ed7aa68ca1f

FREE(str) when str is NULL crashed Scilab.
To test: Demos > Graphics > 2D and 3D plots > plot2d3

Change-Id: I31b1be349649a8df52979f77ddb66877c251424d

[bug_14225] Scilab binary return 1 when an error occured in scilab before exit. Return 0 in succesfull case.

./bin/scilab-cli -e "1+1;" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "1+1; exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "error(\"blabla\");exit(12)" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch, disp(lasterror()),end" -quit;echo $?
./bin/scilab-cli -e "try, error(\"blabla\"); catch,disp(lasterror());exit(12), end" -quit;echo $?

test_run core bug_14225

Change-Id: I3af6be334934d42a1c0677db2a8e62e8d63d8eae

Complete overview and changelog, including in French

Change-Id: Ic531839d07654f55dfd793fda20387b09f30f114

Better names for coverage report

Change-Id: Ic6d74ef5314c559a9707d5941aded0a10b42ccd9

update changes to bug_12044

Change-Id: I14a23cb9fe8575a7e4bd9057996a4752f7cf1d6d

Xcos: save on the GUI and open block settings

Change-Id: Id3468d3d90e5d5f627e8c820bc91f3f934ed70ac

Xcos MVC: implement XCOS / ZCOS file saving

 * Add a DESCRIPTION property for blocks' value
 * Handle both binary and textual saving
 * testing is performed manually using xcosDiagramToScilab calls

Change-Id: If60686a54e87d6b127886d38592f93f9b0bd3ed3

add missing Makefile.in after https://codereview.scilab.org/#/c/17366/

Change-Id: Ia0478a9301a1b55628a8e27c587c1829f4f9738c

Adding or substracting the empty matrix now return an empty matrix

Change-Id: Ib2d41ea4fc44ea3624c849231c01f65aa49bd0c6

Configure: detect Atlas using pkg-config

Change-Id: Ibc050a69a02a902a448bd57df631398ec97728a3

* Bug #14232 fixed - Typo fixes

Change-Id: Ic7e098c3246d667ea0b0ff146fae93048bbe7dae

The initial mode value of ieee function is setted to 2.

Change-Id: Ie3c727863f7bb986e8678aaf9e729a30112c00bc

Java types: implement hashCode()

Change-Id: I3ae1c697b004331929828da231fbd6b132000730

bug_14204: fix swap of error messages in dec2base

Change-Id: Ice980d880897cb0373cf10fb927ed021b5ca052e

Scicos: getting the objs content crashed

Change-Id: I582b7d4a812cd867f5d9302644500c34af77b300

add coverage in Windows installer

Change-Id: I2ed8e398edc2079be03a5b1a782385e6d6c84c10